Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nicn1Q9CQM0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nicn1Q9CQM0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms