Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap3bQ9CQE1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap3bQ9CQE1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms