Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CQ90 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q9CQ90 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms