Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NepnQ9CQ76 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms