Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nudcd2Q9CQ48 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nudcd2Q9CQ48 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms