Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med21Q9CQ39 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med21Q9CQ39 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms