Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
StambpQ9CQ26 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
StambpQ9CQ26 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms