Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ14

Trpd52l3, Tumor protein D52-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpd52l3Q9CQ14 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trpd52l3Q9CQ14 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Trpd52l3Q9CQ14 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms