Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Krt88Q9CPR6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Krt88Q9CPR6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms