Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Prpf8Q99PV0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Prpf8Q99PV0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms