Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Slc26a5Q99NH7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc26a5Q99NH7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc26a5Q99NH7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc26a5Q99NH7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc26a5Q99NH7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc26a5Q99NH7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms