Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SrrtQ99MR6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SrrtQ99MR6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms