Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tm2d1Q99MB3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tm2d1Q99MB3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms