Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gins4Q99LZ3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gins4Q99LZ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms