Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gdpd3Q99LY2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gdpd3Q99LY2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms