Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Chmp1b1Q99LU0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms