Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp16Q99LG0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp16Q99LG0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms