Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clint1Q99KN9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clint1Q99KN9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms