Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hps4Q99KG7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps4Q99KG7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps4Q99KG7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms