Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Krcc1Q99JT5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krcc1Q99JT5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms