Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GatbQ99JT1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GatbQ99JT1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms