Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pacsin3Q99JB8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pacsin3Q99JB8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms