Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apobec3Q99J72 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apobec3Q99J72 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms