Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Smim11aQ99J19 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Smim11aQ99J19 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smim11aQ99J19 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Smim11aQ99J19 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Smim11aQ99J19 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Smim11aQ99J19 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Smim11aQ99J19 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Smim11aQ99J19 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim11aQ99J19 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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