Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc8b1Q925Q3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc8b1Q925Q3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Slc8b1Q925Q3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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