Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PdgfdQ925I7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PdgfdQ925I7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms