Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prss28Q924N9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Prss28Q924N9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms