Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Alpk3Q924C5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Alpk3Q924C5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Alpk3Q924C5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms