Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col20a1Q923P0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col20a1Q923P0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col20a1Q923P0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms