Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn1Q922Y1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn1Q922Y1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms