Protein–RNA interactions for Protein: Q921I2

Klhdc4, Kelch domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc4Q921I2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Klhdc4Q921I2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klhdc4Q921I2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klhdc4Q921I2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms