Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Med28Q920D3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Med28Q920D3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms