Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atl3Q91YH5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atl3Q91YH5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atl3Q91YH5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms