Protein–RNA interactions for Protein: Q91XZ8

Pcdhb22, Protocadherin beta 22, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb22Q91XZ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pcdhb22Q91XZ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcdhb22Q91XZ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdhb22Q91XZ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdhb22Q91XZ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcdhb22Q91XZ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcdhb22Q91XZ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms