Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klhdc3Q8VEM9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhdc3Q8VEM9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms