Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG6

Cnot6l, CCR4-NOT transcription complex subunit 6-like, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6lQ8VEG6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnot6lQ8VEG6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cnot6lQ8VEG6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cnot6lQ8VEG6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms