Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc115Q8VE99 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc115Q8VE99 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms