Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2T8

Gtf3c5, General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5Q8R2T8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gtf3c5Q8R2T8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gtf3c5Q8R2T8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms