Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim29Q8R2Q0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim29Q8R2Q0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms