Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b4Q8QZY9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sf3b4Q8QZY9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms