Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rnf183Q8QZS5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rnf183Q8QZS5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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