Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC33Q8N5R6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC33Q8N5R6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms