Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Treml1Q8K558 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Treml1Q8K558 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms