Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Rdh16f2Q8K3M1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Rdh16f2Q8K3M1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rdh16f2Q8K3M1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rdh16f2Q8K3M1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
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