Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Mtmr3Q8K296 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Mtmr3Q8K296 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Mtmr3Q8K296 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms