Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem17Q8K0U3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem17Q8K0U3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms