Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cog3Q8CI04 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cog3Q8CI04 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms