Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Upp2Q8CGR7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Upp2Q8CGR7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upp2Q8CGR7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms