Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hpf1Q8CFE2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hpf1Q8CFE2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hpf1Q8CFE2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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