Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Nkiras1Q8CEC5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkiras1Q8CEC5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms